Outlast 2的故事圍繞著前調查記者哈里斯（Harris）和他的新搭檔托比（Toby）展開。他們決定繼續調查關於Outlast中未解決的謀殺案件，以獲取新聞素材。在調查過程中，他們發現了證據表明這些謀殺可能與Outlast初代遊戲中的極端邪教“陶德米克斯”（Tudimek）有關，而該邪教與一系列其他事件有關。在遊戲的剩餘部分中，玩家將需要跟隨哈里斯和托比一起探索恐怖事件背後的真相，同時躲避這個神秘邪教的組織者的追捕。他們最終需要證明自己的清白，並揭露那些在邪教組織下的無辜受害者。遊戲的結局將取決於玩家的行為和選擇。
此外，在遊戲的DLC“遊戲內部”中，玩家可以扮演“羅伯特·漢森”（Robert Hess），這是一個擁有多重人格的角色，他們認為自己是哈里斯，想證明自己當初正確的決定，這個DLC在原有的基礎上加入了不同的選擇與視角轉換的新元素，豐富了遊戲的可玩性與多變性。
請注意，上述內容是遊戲官方的設定簡介，對於劇情的理解和選擇可能因人而異。更多詳情建議查閱遊戲官方網站或相關遊戲論壇。