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pfama是什麼意思

Pfama 是指 Pfam 資料庫中的一個子集,即 Pfam-A。Pfam 是一個蛋白質家族及功能域的資料庫,它包含了蛋白質家族的注釋以及由隱馬爾科夫模型建立的多序列比對結果。Pfam-A 是 Pfam 資料庫中經過手工注釋的序列集合,這些序列與其他蛋白質資料庫中的序列具有相同的注釋標籤。Pfam 在其最初版本中參考的是 Swiss-Prot 資料庫,而在最新發布的版本中,主要參考的是 UniProtKB 資料庫。每個 Pfam-A 條目都保存了符合條件的所有序列的比對結果,以及該條目的隱馬爾科夫模型參數。