《NBA 2K13》PSP版的操作主要包括以下幾種：
基礎操作。使用WSAD控制球員移動，空格鍵傳球，小鍵盤3鍵跳步，小鍵盤5鍵投籃或搶斷，DEL鍵籃板，TAB鍵呼叫隊友包夾，左Shift鍵背打，小鍵盤迴車鍵加速。
組合操作。面筐動作包括急停虛晃（向籃筐方向撥動RS搖桿）、減速虛晃（向運球手方向撥動RS搖桿）、內切外帶運球（向運球手方向快速撥動兩次RS搖桿）、變向運球（向非運球手方向撥動RS搖桿）等。
傳球和團隊動作。普通傳球（A鍵）+LS搖桿選擇接球者，擊地傳球（LT鍵+A鍵）+LS搖桿選擇接球者，假傳（快速雙擊A鍵），空中接力（X鍵+A鍵）+LS搖桿選擇接球者等。
投籃和上籃動作。急停跳投（移動狀態下按X鍵），假動作投籃（輕點X鍵），後仰投籃（X鍵+向籃筐反方向撥動LS搖桿），後撤步跳投（按B鍵+向籃筐反方向推LS搖桿+X鍵）等。
此外，還有轉身投籃、拋射上籃、歐洲步上籃、單腿跳步上籃、普通上（扣）籃、轉身上（扣）籃、反向上（扣）籃、拉桿等動作。這些操作是《NBA 2K13》PSP版中比較常用的操作方式，可以讓玩家更好地控制球員進行比賽。