在Word中，腳註的格式可以通過以下方式進行自定義設定：
更改腳註的數字格式。將插入點置於需要更改腳註格式的位置，如果沒有分節，則置於文檔中的任意位置；執行「插入」「引用」「腳註」，打開「腳註和章節附注」對話框；單擊選中「腳註」單選項；在「編號格式」框中，選擇所需的格式類型；如果文檔分為多個節，在「將更改套用於」下拉框中選擇「本節」，則只更改本節的腳註格式；選擇「整篇文檔」，則會更改全文的腳註格式；單擊「套用」按鈕。
設定腳註分隔設定。分隔文檔正文和腳註的短橫線稱為注釋分隔設定，其格式可以設定或改變；切換至普通視圖；執行「視圖」「腳註」，在「查看腳註」對話框中，選擇「查看腳註區」，顯示腳註編輯窗格；在窗格中的下拉列表中選擇「腳註分隔設定」；選擇分隔設定，可進行顏色、框線等格式的修改；選中後按Delete鍵可刪除分隔設定；也可以將其改為其他類型，例如插入「剪貼畫」或鍵入文本符號等；要恢復為默認的分隔設定，可單擊「默認設定」按鈕；在此窗格中，還可以對「腳註延續分隔設定」「腳註延續標誌」等進行設定。
腳註和章節附注的互相轉換。執行「插入」「引用」「腳註和章節附注」，打開「腳註和章節附注」對話框；單擊「轉換」按鈕，打開「轉換注釋」對話框；選擇要進行操作的選項；單擊「確定」按鈕；此時，文檔中的腳註或章節附注已被轉換。
刪除腳註。對於腳註的挪動、複製操作，均需對注釋參考標記下手。