區分倉鼠的公母可以通過以下幾點進行判斷：
體型和體重。一般來說，成年公倉鼠的體型和體重都比母倉鼠要大。
香腺。公倉鼠的香腺比母倉鼠更為明顯。香腺位於腹部中間或腰後兩側，靠近大腿的部位，形狀類似圓形的結痂疤痕。分泌物為乳白色粘稠液體，凝固後呈現黃色。香腺的功能是分泌氣味，吸引異性或標記領地。
乳房。母倉鼠的乳房比公倉鼠更為明顯，腹部有雙排扣狀的乳頭，而公倉鼠的乳房不易看見。
生殖器和肛門的距離。母倉鼠的生殖器離肛門很近，而公倉鼠的生殖器離肛門較遠。
屁股形狀。母倉鼠的屁股比較尖，呈三角形；公倉鼠的屁股比較豐滿，較大，成熟的公倉鼠睪丸也比較明顯。
生殖器形狀。雄性倉鼠的生殖器官（陰莖）在性成熟時變得明顯，可以通過觀察其形狀和位置來判斷性別。