原型兵器2的故事劇情主要圍繞著天馬和夜影兩大組織之間的戰鬥展開。
在遊戲中，玩家將扮演一名被稱為“原型兵器”的戰士，被投入一場龐大的戰爭中。遊戲的主要劇情圍繞著角色成長、探索、戰鬥和解謎等元素展開。玩家需要與各種敵人和Boss進行戰鬥，以提升自己的能力，並解鎖新的技能和武器。
此外，故事還涉及到了兩個對立的組織——“天馬”和“夜影”，這兩個組織之間的衝突是遊戲的主要劇情線。他們各自擁有不同的力量來源，以及各自的信仰和目標。他們的鬥爭導致了一系列的事件，影響了整個星球的命運。
遊戲中的對話和選項也會影響劇情的走向，讓玩家可以有更多的選擇來決定角色的命運和故事的發展。總的來說，原型兵器2的故事劇情豐富、引人入勝，並通過選擇的影響力增加了遊戲的趣味性和深度。