吸砂泵的工作原理主要基於葉輪的旋轉產生的離心力和負壓區。
當電機驅動葉輪旋轉時，葉輪產生離心力，迫使水流沿葉片流動，形成高速旋轉的水流。這個高速旋轉的水流在葉輪內部產生一個負壓區，使得周圍的水流被吸入葉輪。隨著水流被吸入葉輪內部，離心力的作用使水流加速流動，動能增加，並產生較大的壓力，推動水流從低壓區向高壓區流動。最終，水流通過管道輸送到需要清理的地方，如河道、港口等，在輸送過程中，高壓水流可以有效地沖刷並輸送泥沙等雜質，達到清淤的目的。
此外，吸砂泵通常具有攪拌葉輪，可以將沉澱於水底的淤渣攪拌成湍流後抽取出來。泵的主要過流部件如葉輪、攪拌葉輪等通常採用高耐磨材質製造，以耐磨損、耐腐蝕、無堵塞、排污能力強，有效地通過較大的固體顆粒。