除垢咖啡機的方法有多種，其中一些常用的方法包括：
檸檬清洗法。將新鮮檸檬切片放入咖啡壺內，加入適量清水，然後運行咖啡機一次。檸檬中的檸檬酸可以溶解水垢，同時給咖啡機一種特殊的酸味。
白醋清洗法。向咖啡機的水箱中注入適量的白醋和清水混合液，然後運行咖啡機。白醋中的醋酸可以溶解水垢，且不會對咖啡機和人體造成危害。
蘇打水清洗法。將適量蘇打水加入清水中，然後運行咖啡機。蘇打水的鹼性成分可以幫助溶解水垢。
使用專用除垢劑。按照說明書比例將除垢劑加入水箱，並運行咖啡機。這種方法適用於大多數類型的咖啡機。
氫氧化鈉清洗法。將適量的氫氧化鈉加入清水中，然後運行咖啡機。使用氫氧化鈉時需小心，因爲它可能對咖啡機和人體產生危害。
在進行除垢時，應遵循咖啡機制造商的指導手冊中的具體說明。如果咖啡機有特定的除垢程序，應按照指示操作。除垢後，用流動的水清洗咖啡機的各個部件，並確保徹底沖洗乾淨。