日元符號和人民幣符號之間有三種區別，具體如下：
中間的橫線數量不同。日元符號“￥”中間有一橫，而人民幣符號“¥”中間有兩橫。
誕生過程不同。人民幣符號其實是由日本的圓形貨幣符號“円”演變而來，兩者在外觀上非常相似。人民幣符號在使用時通常表示的是人民幣的貨幣單位，例如“100元人民幣”可以寫成“¥100”，而日元符號則表示的是日本的貨幣單位，例如“100日元”可以寫成“￥100”。
使用方式不同。在國際貿易中，人民幣符號通常使用ISO 4217標準中的“CNY”，而不是“¥”，這是因爲“CNY”是國際通用的人民幣貨幣代碼，可以避免不同國家對“¥”符號的誤解。而日元符號“￥”則在國際上也通常使用ISO 4217標準中的“JPY”。