杭州捷運的票價採用里程分段計價方式。對於普通乘客，票價從2元起步，2元可以乘坐4公里。當乘坐距離增加到4-12公里時，每增加1元可以多乘4公里；當距離在12-24公里時，每增加1元可以多乘6公里；而當距離超過24公里後，每增加1元可以多乘8公里。對於1號線，起步價同樣為2元/人次，但最高票價為9元/人次。
此外，杭州捷運還提供了旅遊票，包括一日票和三日票。一日票的售價為15元/張，三日票的售價為40元/張。旅遊票的使用有效期長，一日票在首次刷卡進站後的24小時內無限次乘坐，三日票則在首次刷卡進站後的72小時內無限次乘坐。這些旅遊票不限線路、不限車站、不計里程、不計次數、不回收。
最高票價可能會根據線路的長短有所變化。例如，新線開通後，最高票價可能達到17元，這可能是從九州街站（16號線）到江東二路站（7號線）的全程票價，因為這條線路的長度超過100公里。
對於殘疾人，杭州捷運提供免費乘車服務。老人和學生則可以享受車票5折的優惠。使用公交卡乘坐捷運時，普通乘客可以享受9.1折的優惠。