柴油、重油和液化氣
漁船通常使用的燃料包括柴油、重油和液化氣。柴油是捕魚漁船常用的燃料之一，其特點是能夠在較低的溫度下自燃，廢氣排放量較低，被認爲是一種較爲環保的燃料。重油是從石油中提取出來的粘稠油脂，價格便宜但熱值較低，污染物排放量較高。液化氣也是一種燃料選擇，其燃燒產生的廢氣排放量更低，且儲存和運輸方便。此外，生物柴油也是一種環保的燃料選擇，以植物油或動物脂肪爲原料生產，燃燒產生的二氧化碳排放量較低。
船舶燃料油可以根據理化性能進行分類，如十六烷值、熱值、粘度、硫分、灰分、殘炭值、釩和鈉含量等。燃油的注入通過甲板兩舷的燃油法蘭注入接頭將燃油直接注入艙內，加油過程中需要注意溫度、密度換算和溫度修正，以及油品的儲存和駁運。