在《火影世界》中修行主要包括以下幾種方式：
打坐。這是最基本也是最重要的修行方式。玩家可以通過界面功能條中的【打坐】按鈕或使用快捷鍵"X"進行打坐。打坐時，玩家可以獲得經驗和查克拉精華，具體收益取決於打坐的時間長度。夜間0點至8點期間，全服系統提供雙倍打坐時間，這是獲取經驗的好機會。
雙修。雙修是一種特殊的修行方式，要求兩位玩家同時處於打坐狀態，並且彼此距離很近。雙修可以加快查克拉精華與經驗的獲得速度，比單獨打坐快20%。
修行。修行是另一種獲取經驗和查克拉精華的途徑。玩家可以通過消耗修行令符來領取雙倍收益。修行每12小時為一輪，之後收益將停止增長，需要及時領取。在領取修行收益時，使用【修行密卷】可以領取雙倍修行收益。
修煉心法。玩家可以在打坐的同時選擇修煉心法，這可以在很大程度上減少銅幣和查克拉精華的消耗，提高修行效率。
以上方法結合使用可以大大提高玩家的修行效率，讓玩家在《火影世界》中更快地成長。