玻璃瓶的清洗消毒可以通過以下幾種方法進行：
煮沸法。將玻璃瓶的各個部件如瓶身、奶嘴、奶瓶座和奶瓶蓋等用清水清洗乾淨後，放入不鏽鋼鍋中，加冷水至完全覆蓋玻璃瓶，用中火加熱至沸騰，然後調至中低火繼續煮10分鐘，煮沸後自然放涼。
蒸汽消毒法。將清洗乾淨的玻璃瓶和奶嘴等放入蒸汽消毒鍋內，打開開關進行消毒，通常上汽後3~5分鐘關火，讓奶瓶自然冷卻。
使用專業消毒器。按照消毒器的使用說明書，完成整個消毒過程。
酒精消毒。對於無法放入煮沸或蒸汽消毒器中的大瓶子，可以使用高酒精度的蒸餾酒或食用酒精進行消毒，用酒精浸透的廚房紙巾仔細擦拭玻璃瓶內外，然後立著放在廚房紙巾上晾乾。
烤箱消毒。適合存放加熱的食材或短期保存的食品，需準備耐高溫的玻璃瓶和金屬瓶蓋，消毒後倒著放置5分鐘，然後翻過來保存。
過氧乙酸溶液消毒。適用於專業清洗消毒場合，使用過氧乙酸溶液對沖洗後的玻璃瓶進行噴淋消毒，然後瀝乾。
此外，每次餵奶後應立即清洗奶瓶，包括奶嘴和瓶頸等部分，使用專用的清洗劑和奶瓶刷，清洗後用流動水沖洗乾淨，倒扣在通風處晾乾。定期消毒，每天至少一次，可以使用煮沸、蒸汽消毒、微波爐消毒或專用的消毒鍋。