甲基化是一種重要的化學修飾過程，廣泛存在於生物系統中，主要包括DNA甲基化和蛋白質甲基化兩種形式。在生物系統內，甲基化是經酶催化的，涉及重金屬修飾、基因表達的調控、蛋白質功能的調節以及核糖核酸加工。
以下是甲基化方法的套用：
蛋白質甲基化。蛋白質甲基化通常涉及精氨酸或賴氨酸的甲基化，對基因表達有表觀遺傳影響。蛋白質甲基化分析方法包括高效液相串聯質譜法和抗體法，這些方法可以鑑定蛋白質的甲基化水平、位點。
DNA甲基化。DNA甲基化是調控基因表達和維持基因組穩定性的重要機制。常用的DNA甲基化檢測方法有重亞硫酸鹽轉化法、甲基化特異性PCR(MS-PCR)、亞硫酸氫鹽處理加測序、聯合亞硫酸氫鈉的限制性內切酶分析法(COBRA)和螢光定量法(Methylight)。這些方法各有優劣，適用於不同的研究需求和樣本類型。
此外，還有Hakomari-Ciucanu-Needs法，這是一種化學甲基化方法，適用於多糖的甲基化。每種方法都有其特定的套用場景和限制，因此選擇合適的方法對於實現有效的甲基化分析至關重要。