異染色質（heterochromatin）是指在細胞週期中具有固縮特性的染色體區域。它通常位於染色體的中心區域、染色體末端和某些特定的染色體區域。在細胞間期及早前期時，異染色質以凝集狀態存在，染色較深，這是因爲其染色質纖維摺疊壓縮程度高，處於聚縮狀態。異染色質的DNA分子與組蛋白等緊密結合，螺旋纏繞緊密，很少轉錄，功能上處於靜止狀態，是低活性的染色質。
異染色質又分爲結構異染色質和兼性異染色質。結構異染色質指的是各種類型的細胞除複製時期外在整個細胞週期均處於聚縮狀態，DNA包裝在整個細胞週期中基本沒有變化的染色質。它由相對簡單、高度重複的DNA序列構成，具有顯著遺傳惰性，不轉錄也不編碼蛋白質。兼性異染色質則是指在某些細胞類型或一定的發育階段，原來的常染色質凝縮，喪失基因轉錄活性，變爲異染色質。