糖原通常在肝細胞和肌細胞的細胞質基質中合成。
糖原合成是一個複雜的過程，需要多種酶的參與，糖原合酶在此過程中起到關鍵作用，能夠催化葡萄糖殘基轉移到糖原分子上。糖原合成的過程如下：
首先，葡萄糖需要經過一系列的化學反應，轉化為尿苷二磷酸葡萄糖(UDPG)，這是糖原合成的底物。
在糖原合酶的作用下，UDPG上的葡萄糖殘基轉移到糖原分子上，形成α-1，4-糖苷鍵，從而延長糖鏈。
當糖鏈長度達到一定程度後，糖原分支酶會發揮作用，將糖鏈轉變為分支結構，增加糖原的溶解度。
通過這種方式，糖原在細胞質中逐漸合成並儲存起來。