花椒是一種多功能的調味料，用途非常廣泛。在烹飪方面，花椒適合在炒菜的中後期加入，以保留其香味並避免過度揮發。燉煮或滷菜時，花椒可以在食材快熟時加入。此外，花椒還可以製成花椒油、花椒水或花椒麵，用於不同種類的菜餚，提供獨特的香氣和風味。
花椒還可以與其他香料如大料、桂皮、香葉等搭配使用，以增強菜餚的層次感和風味。但需注意香料之間的比例，以免味道過於複雜。
除了作為調味料外，花椒還具有多種藥用價值，如殺菌、消毒、止痛、止癢和消腫。它可以用於治療牙痛、痛經、風寒咳嗽等症狀。花椒的痲味較強，使用時應根據個人口味和菜餚的需要適量添加。孕婦和陰虛火旺者應慎服，高血壓者應避免食用。
在中醫中，花椒被認為具有溫中散寒、除濕止痛的效果，可用於內服或外用。例如，花椒可以用於製作熱敷包，緩解腰酸背痛、關節炎等症狀；花椒泡腳被認為可以溫通血脈，驅寒祛濕；花椒煮水飲用，可以改善胃寒引起的腹痛。
此外，花椒還有驅蚊、防螞蟻、防止米蟲等家居用途，以及快速止癢、防止腳臭等個人護理功效。