菌根植物包括多種類型的植物，它們與土壤中的真菌形成共生關係。根據菌根的類型，這些植物可以分爲以下幾類：
外生菌根植物。這類植物包括櫟、松、柳、椴、楓、胡桃和樺科等樹木，以及一些草本植物。外生菌根的真菌菌絲包裹在植物根的外側，有時侵入根的皮層細胞間隙中，但不進入細胞內。
內生菌根植物。這類植物包括蘭科植物、柏、雪松、紅豆杉、核桃、白蠟、楊、楸、杜鵑、槭、桑、葡萄、李、柑橘、茶、咖啡和橡膠等樹木。內生菌根的真菌菌絲侵入細胞壁並進入到細胞內。
叢枝菌根植物。這類植物主要存在於多種農作物中，包括豆科和禾本科植物，如玉米、小麥、大豆、菜豆、馬鈴薯、番茄等。
此外，還有一些特定的菌根類型，如漿果鵑類菌根、水晶蘭類菌根和歐石楠類菌根等，它們與特定的植物種類相關聯。這些菌根關係對於植物的營養吸收和生長至關重要，同時也促進了真菌在土壤中的傳播和持久。