番茄的施肥時間可以根據其生長周期和不同的發育階段進行劃分，主要包括以下幾個關鍵時期：
苗期。一般不需要施肥，因為育苗土已含有足夠的肥料。
定植前。施用有機肥，如蚯蚓糞或羊糞，每棵大約2湯勺。
定植後10至15天。進行第一次施肥，可以使用魚蛋白或稀釋後的40-10-10肥料進行灌根。
花芽時期。施肥時使用磷二灌根，同時施加2湯勺的開花有機肥。
開花期。使用羊糞、鉀肥和硼肥，同時進行液體肥料每周一次的施用。
第一次收穫後。使用魚蛋白和磷二，每5天一次。
番茄進入盛果期。可以追施2至3次氮肥，每次施用時可以配以磷和鉀肥。
根系吸肥能力下降的時期。可以進行葉面噴施，如使用0.3%至0.5%的尿素、0.5%的磷酸二氫鉀、0.1%的硼砂等。
此外，在春季和秋季的上午為番茄提供養分，夏季則在清晨施肥。對於保護地栽培下的番茄施肥，要防止施肥過多引起的鹽分障礙，施肥時應增加有機肥投入，化肥用量比露地可減少20%至30%，並且宜少量多次施用。