赤潮是一種複雜的海洋現象，其原因多樣，以下是赤潮產生的主要原因：
水體富營養化。主要是由於人類活動，如工業和農業廢水、生活污水的排放，導致大量營養物質（如氮、磷等）進入海洋，造成海域富營養化，為藻類生物的大量繁殖提供了條件。這些營養物質導致藻類及其他浮游生物迅速繁殖，從而引發赤潮。
特定的環境條件。如高溫、低風速條件，以及適宜的鹽度範圍（26至37），這些都是赤潮發生的理想環境條件。
全球氣候變化的影響。如水溫升高和海洋酸化，也促使赤潮的發生更加頻繁。
此外，赤潮還與人類活動有關，如沿海地區的開發、海水養殖業的擴大、外來有害赤潮種類的引入，都是導致赤潮頻繁發生的重要因素。