治療車輪蟲病的方法有多種，硫酸銅和硫酸亞鐵是常用的藥物組合。
這兩種藥物按一定比例（通常是5:2）混合後，全池潑灑，使用時要注意配比和用量，以避免對魚體造成過度傷害。還可以使用苦蔘鹼溶液，每1立方米水體使用0.4克的苦蔘鹼，全池潑灑1到2次，在嚴重感染時，可以將苦蔘鹼溶液和阿維菌素溶液配合使用。另外，敵百蟲也是一種有效的治療藥物，特別是在魚苗階段，使用2mg/L的敵百蟲全池潑灑。
治療車輪蟲病時，還應注意改善養殖環境，如加強池塘管理、確保增氧機正常運轉、注意水質變化和魚的攝食情況等。在治療過程中，適時使用消毒劑如聚維酮碘等來預防細菌性疾病的發生也很重要。重要的是，根據具體情況選擇合適的治療方法，並嚴格按照推薦的劑量和使用方法進行操作，以避免對魚類和水體環境造成不必要的傷害。