股東退股的清算方式取決於具體情況和公司章程的規定，主要包括以下幾種方式：
基於淨資產退股。這種方式是根據公司在退股時的實際價值來計算股東的退出金額。例如，如果一個股東從價值100萬的企業中退股，而企業的淨資產為80萬，則該股東可以獲得的退款為80萬。
打折退出。這是指根據股東投入資金的折扣率來計算退款金額，例如，如果股東一年內退出，可能只能按投入資金的7折或8折退款。
根據契約條款清算。如果股東之間有特別的契約條款，比如鎖定期、虧損期退股或分期退股等，也可以根據這些條款進行清算。
司法評估。如果股東之間無法達成一致意見，可以通過司法途徑進行評估和清算。
對於公司整體的清算流程包括：
調查公司財產狀況並進行清理。
制訂清算方案，包括編制資產負債表和財產清單等。
股東會議確認或相關部門批準清算方案。
如果存在未償還債務且公司無力償還，應向人民法院申請宣告破產。
對於特殊情況下的清算，如股東可申請人民法院強制解散公司。
總的來說，股東退股的清算方式多樣，需要根據具體情況和公司章程來決定。