魚之所以不能呼吸，是因為它們主要通過鰓來從水中提取氧氣。魚鰓的結構使得它們在水中能夠高效地吸收氧氣，但在空氣中則無法有效地進行氣體交換。具體原因包括：
魚鰓的設計是為了在水中高效吸收氧氣。魚鰓片、鰓絲和鰓小片都完全張開，增加了與水的接觸面積，從而更好地攝取水中的溶解氧。當血液流過鰓小片時，通過微血管完成氣體交換，釋放二氧化碳並吸收氧氣。然而，一旦離開水，這些結構就會黏連在一起，大大減少與空氣的接觸面積，導致無法有效吸收足夠的氧氣來維持生命。
氧氣在水中的溶解度遠低於空氣中。在20℃和一個標準大氣壓下，一升水中只能溶解約9毫克的氧氣，這一量遠遠低於空氣中的含氧量。因此，魚在水中需要不斷地吞咽水來保證足夠的氧氣供應。
水溫的變化也會影響水中氧氣的溶解度。水溫升高時，氧氣的溶解度會迅速下降，可能導致水中的溶氧量不足以供魚呼吸。
魚在水中可能會遇到各種障礙，如被網具、大型藻類或水中的垃圾纏住，導致鰓蓋無法張開，無法形成流過鰓絲的水流，從而無法吸收足夠的氧氣。
因此，魚雖然能在水中呼吸，但在離開水或水中缺氧的環境下會遇到呼吸難題。