超分子通常是指由兩種或兩種以上的分子，通過分子間的相互作用（如氫鍵、靜電作用、疏水作用、π-π鍵作用等）結合形成的複雜、有序的聚集體。
這些聚集體具有明確的微觀結構和巨觀特性，不同於單獨分子的性質，超分子展現出新的物理和化學性質，如改變分子的熔點、磁性、電容性、導電性、發光性和水溶性等。超分子化學是研究這些現象和套用的科學，它代表了化學研究的一個前沿領域，涉及分子識別、分子間相互作用的精確調控，以及在分子水平和結構特徵上的信息存儲和處理。超分子在物理學、材料科學、信息科學、環境科學和生命科學等多個領域中都有重要的套用。