保存微生物的方法多種多樣，每種方法都有其特定的套用場景和優勢。常用的微生物保存方法包括：
凍乾保藏法。通過將微生物與保護劑（如甘油）一起冷凍，並在真空條件下使水分升華，然後進行密封保存。這種方法適用於長期保存，能有效保持微生物的活性和形態。
深低溫保藏法。將微生物在極低溫度（如液氮或-80℃冰櫃）下保存。在此溫度下，微生物的代謝活動大大降低，有效減緩變異和死亡過程。
液體石蠟覆蓋保藏法。在微生物培養物上覆蓋一層滅菌的液體石蠟，可以防止水分蒸發並減少氧氣接觸，從而延長保藏時間。
固體曲保藏法、砂土管保藏法。適用於產生孢子的微生物，通過將微生物吸附在固體載體（如沙子或矽膠）上進行乾燥保藏。
瓊脂穿刺保藏法。適用於某些特定類型的微生物，通過將微生物接種到瓊脂中，進行保存。
斜面保存法。將微生物接種在斜面培養基上，適用於多種微生物的短期保存。
液體保藏法。將微生物懸浮於特定溶液中（如蒸餾水、糖液、磷酸鹽緩衝液等）進行保存。
選擇合適的保藏方法取決於微生物的種類、保存期限以及是否需要保持其遺傳穩定性。例如，對於需要長期保存的微生物，凍乾保藏法或深低溫保藏法更為合適；而對於需要頻繁使用的微生物，斜面保存法可能更為方便。