在南京，繳納社保的方式有多種。對於靈活就業人員來說，可以選擇以下幾種方式進行社保繳納：
通過線上渠道繳費。靈活就業人員可以利用「我的南京」APP、「江蘇稅務」APP、支付寶、微信、「江蘇政務服務」APP等線上渠道進行養老保險選檔繳費和醫療保險、失業保險繳費。如果通過線上渠道變更養老保險繳費檔次，需要同步進行繳費，否則變更無效。
銀行櫃面繳費。攜帶有效身份證件，前往中國建設銀行、中國農業銀行、中國工商銀行、中國郵政儲蓄銀行、南京銀行、中國銀行、溧水農商行等銀行的任一營業網點櫃面辦理養老保險選檔繳費和醫療保險、失業保險繳費。
委託銀行扣款繳費。與上述銀行之一簽訂委託扣款協定，委託銀行按月進行扣款繳費。
微信和支付寶繳費。通過微信「江蘇稅務社保繳納」小程式、支付寶「江蘇稅務社保繳納」小程式進行自助繳費。
綁定銀行代扣。確保銀行卡內有足夠的餘額，每月26日至月底，銀行會自動從賬戶中扣除相應的社保費用。
對於單位而言，社保繳納方式主要包括委託銀行收款、單位自繳和地稅代收。單位自繳需要查詢當月應交數據，並在規定時間內轉賬至社保費賬戶，然後在地稅局列印收據。