忍者之魂在遊戲中的用途主要包括以下幾點：
提升忍者屬性：忍者之魂可以用來提高單個忍者的攻擊力、生命值和防禦力等個體屬性，從而增強忍者的戰鬥力。
裝備品質和等級提升：忍者之魂還可以用來提升裝備的品質和等級，使忍者裝備更強大，在戰鬥中更具競爭力。
英雄進階：忍者之魂用於英雄進階，通過提供大量的經驗值，快速提升英雄的等級和屬性，使其成為更強大的角色。
解鎖新技能：忍者之魂還可以幫助忍者解鎖新的技能，通過使用忍者之魂，忍者可以增強原有技能，並學習新的戰鬥技能。
突破強化：忍者之魂用於忍者的突破，大幅提升忍者的屬性，並提高忍者的等級上限。
感悟或提升羈絆等級：在《火影忍者:手遊》中，忍者之魂還用於感悟或提升羈絆等級，與魂玉配合進行升級。
獲得其他資源：忍者之魂也可以用來購買一些高級物品或魂石，魂石是一種可以用來提升戰力的道具。
通靈獸召喚：忍者之魂可通過通靈獸召喚或通靈之術召喚獲得，需要消耗一定數量的忍者之魂和金幣。
綜上所述，忍者之魂是遊戲中非常重要的資源之一，它對於提升忍者屬性、裝備品質、英雄進階、解鎖新技能、突破強化以及獲取其他資源等方面都有重要作用。