漆黑的魅影5遊戲的三周目攻略如下：
從橙華森林中間進入，捕捉Lv.30的雪拉比。
從夢之實驗室到世界狹縫，挑戰小智，面對Lv.100的天蠍王、赫拉克羅斯、蜥蜴王、噴火龍、皮卡丘、卡比獸。
再次對話後，與火箭隊戰鬥，其精靈為Lv.100的梅卡陽瑪、雙彈瓦斯、阿柏怪、大食花、果然翁、海月水母。
進入夢世界，在夢源鎮最下方的房子裡睡覺，可捕捉Lv.50的克雷賽利亞。
向下進入紅蓮之窟，向上後進入可捕捉Lv.30的維庫提尼。
映海市向下衝浪，潛水到兩個激流中間偏右的位置，進入後可捕捉Lv.30的瑪娜菲。
寒瀑鎮衝浪向上走，盡頭可捕捉Lv.30的凱爾迪奧。
使用魅影水晶傳送到月魘鎮，在這個房子的床上睡覺，可捕捉Lv.50的達克萊伊。
在月魘鎮商店，進行惡系道館的挑戰，館主精靈為Lv.92的瑪狃拉、鬼盆栽、月精靈、阿勃索魯。勝利後得到TM41惡之波動。
傳送到輪迴鎮，對話後可捕捉Lv.70的基拉帝納。
回到現實世界，飛到水靜市，向上走挑戰魅影摩天樓。共有六個地區可以挑戰，包括關東地區的八個館主及四天王和冠軍。