在動漫《火影忍者》中，以下角色已經去世：
三代火影：猿飛日斬，在中忍考試時與大蛇丸對決，使用屍鬼封盡與兩位老師同歸於盡，為木葉村犧牲。
猿飛阿斯瑪：作為三代火影的兒子，木葉村近戰精英上忍，因沒有飛段的數據而被飛段殺死。
自來也：作為完美型忍者，為了獲取佩恩的情報而獨自闖進佩恩的總部，最終被佩恩六道殺死。
宇智波鼬：木葉村的精英忍者，為了村子和弟弟的安危，親手毀滅宇智波一族，並去曉組織當臥底，最終為了幫助忍界破解穢土轉生而犧牲。
長門：作為曉組織的領導人之一，最終在戰鬥中犧牲。
日向寧次：在第四次忍界大戰中，為了保護鳴人和雛田，以自己的身體抵擋十尾的扦插之術後壯烈犧牲。
小南：為了守護長門和彌彥的遺體，與帶土一戰後失敗，慘死於帶土之手。
漩渦玖辛奈：為了兒子鳴人，甘願死在九尾的手裡。
彌彥：被帶土設計利用，被山椒魚半藏逼死，導致了長門的暴走。
宇智波止水：被團藏挖掉右眼後，將左眼和最強幻術別天神託付給鼬，後因保護村子而犧牲。
奈良鹿久：在最後的大戰中擔任總部的指揮工作，被十尾的尾獸玉擊中不幸陣亡。
以上列出的角色都是在《火影忍者》中已經去世的重要角色。