醫學碩士和醫學博士在多箇方面存在顯著差異：
學習時間不同。醫學碩士通常需要2-3年的學習時間，而醫學博士的學習時間則更長，大約爲4-6年。醫學博士課程要求更高，包括課程學習、實踐環節、論文撰寫等，整個過程更爲繁瑣複雜。
學術要求不同。醫學碩士培養具備醫學科學思維能力和獨立從事醫學研究的高級專門人才，強調紮實的醫學基礎理論和技能、較強的實驗技能和科研能力。而醫學博士是更高層次的專業人才，要求在醫學科學領域有深入的學術研究和創新能力，並承擔大型研究項目的設計和執行、高水平論文的撰寫等，更加強調學術研究和科研創新。
導師團隊和獨立性不同。醫學碩士一般依附於導師團隊進行學習和科研，學習時間相對較短，對導師團隊的影響不顯著。而醫學博士的學習時間更長，因此對導師團隊的影響更大，被賦予更大的獨立性和探索性，參與主導性研究項目的實施和論文撰寫。
職業前景不同。醫學博士在醫療機構、科研院校、研究機構、企業等領域的就業範圍更廣，職位等級和薪酬優勢明顯。而醫學碩士的就業領域相對較少，主要在醫療機構、科研機構、醫學院校的教學科研崗位等。
申請條件不同。醫學碩士一般要求具備醫學專業本科或大專學歷，且有醫學研究方面經驗。而醫學博士通常要求具備醫學碩士或以上學位，在醫學、生物醫學、公共衛生等領域有深入研究和具體成果，具備科研實踐經驗和發表高水平論文的能力。
綜上所述，醫學博士和醫學碩士在學術要求、學習時間、導師團隊、職業前景和申請條件等方面存在顯著差異。