阻焊印刷的主要缺陷包括：
油墨附著力不強。這可能是由於油墨型號選擇不合適、印刷體表面未經過處理或處理不完全、添加劑的用量不適當或不正確、濕度過大等原因導致。解決方法包括換用適當的油墨、加絲印前處理工序、完善前處理工序、調整添加劑的用量、提高空氣乾燥度。
堵網。這通常由乾燥過快、印刷速度過慢、油墨粘度過高、稀釋劑不適合等原因造成。解決方法包括加入慢乾劑、提高速度加慢乾劑、加入油墨潤滑劑或特慢乾劑、使用指定稀釋劑。
滲透和模糊。可能是因為油墨粘度過低、絲印壓力過大、膠刮不良、網板與印刷表面的距離間隔過大或過小、絲印網的張力變小等原因。解決方法包括提高濃度，不加稀釋劑、降低壓力、更換或改變膠刮絲印的角度、調整間距、重新製作新的網版。
白斑和微裂紋。這通常發生在層壓基材內部，可能是由於板材經受不適當的機械外力衝擊、板材受到含氟化學藥品的滲入、受到不當的熱應力作用等原因造成。解決方法包括避免機械外力衝擊、調整熱應力條件、避免化學藥品接觸。
起泡和針孔。可能是由於油墨粘度過高、絲印時絲網離板速度過快、台面不平整等原因。解決方法包括降低粘度、降低離板速度、調整或更換台面。
此外，還有諸如漏印、油墨起皺褶、阻焊膜缺陷等問題也是阻焊印刷過程中可能遇到的主要缺陷。