大浮萍的花期在6～7月，花單性同序，下部雌花序具單花，上部雄花序有雄蕊2，輪生，雄蕊極短，彼此合生成柱，雄蕊柱基部寬，無柄，長卵圓形，頂部稍扁平，花葯2室，對生，縱裂；雌花單一，子房卵圓形，斜生於肉穗花序軸上，1室，胚珠多數。