政策局是國家自然科學基金委員會的職能局，主要負責國內外自然科學基礎研究的發展趨勢與環境的分析和學科政策研究。它的工作職能與任務包括：
負責國內外基礎研究發展趨勢與環境的綜合分析、學科政策研究；
研究、擬定科學基金髮展的戰略方針，提出政策建議；
提出有利於完善科學基金管理體制、運作機制與評價體系的對策；
負責起草委重要檔案；
負責制定科學基金管理法規規範；
組織擬定科學基金法規建設規劃；
綜合協調和組織審核委內各部門擬定的有關政策、規章和辦法；
提供科學基金重大科技政策諮詢服務；
承擔委領導交辦的其他工作。
政策局下設局秘和三個業務處：發展戰略處、學科政策處、法規處。