清洗玻璃器皿的方法取決於器皿的類型和污垢的性質，以下是幾種常見的清洗方法：
實驗室常用器皿。例如燒杯、錐形瓶等，可以先倒去污物，用自來水沖洗，再加入洗滌劑刷洗，之後用自來水沖淨洗滌劑，最後用純水淋洗三次。對於精密刻度的玻璃儀器，如滴定管、移液管等，不宜使用刷洗以免損傷刻度線，建議使用專用清洗消毒機、專用清洗劑和程式進行噴淋沖洗和吹乾。
手工清洗。先用自來水與毛刷清洗，然後用純水沖洗2至3遍，並晾乾。
浸泡清洗。將玻璃器皿放入40至50℃的溫水中浸泡15至30分鐘，以軟化污漬。使用洗潔精和海綿或軟布輕輕擦拭，之後用清水沖洗乾淨並自然晾乾。
特殊污漬清洗。如果存在有機物沉澱，可以使用煮沸的有機溶劑或氫氧化鈉溶液清洗。對於汞齊、油漬、油漆等，可以使用氨水、氯仿、熱肥皂水或氫氧化鈉溶液浸泡清洗。不同污斑（如白色污斑、鐵鏽斑點、二氧化錳斑點等）可能需要使用不同的化學溶液進行清洗。
使用特定清洗劑。如鉻酸洗滌液、工業濃鹽酸、草酸溶液、磷酸三鈉溶液、硝酸溶液、乙二胺四乙酸二鈉溶液、尿素洗滌液等，根據不同的污漬和器皿類型選擇合適的清洗劑。
根據玻璃器皿的材質和實驗要求，選擇合適的清洗方法非常重要，以避免損傷器皿或影響實驗結果。