碳硼烷酸是一種已知的最強酸，具有廣泛的套用。它主要用於製造「酸化」的有機分子，這些有機分子在自然界中存在的時間短暫，通過研究它們，科學家可以更深入地了解物質變化的機理。碳硼烷酸也被用於化學和化學工業，作為一種無污染的酸催化劑，在醫藥、化工等行業有著重要的作用。
此外，碳硼烷酸的酸性非常強，其強度是濃硫酸的一百萬倍、氟磺酸的數百倍。由於其強腐蝕性和吸濕性，它在很多場合可以替代傳統的硫酸、鹽酸等無機酸，最佳化和改進工藝。碳硼烷酸還可以在非水溶液中表現出強酸性，甚至在乙腈、乙酸等多種溶質中，其酸性通常強於無機酸HCl或H2SO4。
碳硼烷酸還可以用於催化分支烷與芳香化合物的烷基化反應，以及單烯的聚合，製造有用的高分子。