《上帝的跳蚤》這本書寫的是歷史，但卻不是人們習慣看到的歷史。歷史雖然是人寫的，但卻不一定是人類所能主宰的，真正主宰歷史的是微生物。這本書寫的就是這樣一個歷史。
從葬送了蒙元王朝的鼠疫，人類花了四五千年才將之消滅的天花，到推進第一次世界大戰結束的西班牙女郎，現在還沒有征服的愛滋病，人類能走到今天，不是依靠上帝，而是相信科學的力量。這本書或許想傳達的就是這個道理吧。
當鼠疫害死數以百萬的人民時，上帝，你在哪裡？
當天花驟然綻放於世界時，上帝，你在哪裡？
當西班牙女郎風捲殘雲般吹遍地球時，上帝，你在哪裡？
當愛滋病橫空出世之時，上帝，你在哪裡？
他們說，「上帝是萬能的主」，可是，當人類真正面臨著世界性的災難時，上帝，你去哪兒了？當人們不斷向你禱告時，上帝，你聽得見嗎？有人說，每次每次的災難是你控制人口的方法，如果人類真的聽信此言，或許已經沒有今天了。()
或許吧，上帝你的袖手旁觀推進了人類前進的步伐。我們人類之所以能在一次又一次的災難爆發時倖免遇難，就是因為我們具有堅毅、頑強的品質，我們不斷發現、不斷發明、不斷創造，靠自己的力量有所成就。
科學和上帝對比，科學對於我們的幫助與支持卻是更多的。科學也有失誤，但科學的失誤和自大並不代表科學的無能，對付瘟疫，人類能夠仰仗的只有科學。我們應該堅信科學最終能夠戰勝瘟疫，也許這一天對當時的人類來說更為久遠，但是毫無疑問會有那麼一天。每次瘟疫的出現就是上帝對科學的一次修正，也是一次考驗，更是一次激烈，醫學科學本身就是在人類和疾病的鬥爭中不斷前進的。如同這本書的書名一樣，《上帝的跳蚤》，你永遠不知道它什麼時候出現，但又隱隱約約感覺到他就在我們身邊潛伏著，等待著一個好的時機一鳴驚人……